Spółka Energetyczna Jastrzębie znalazła się na liście firm, posiadających instalacje do wytwarzania energii elektrycznej, objęte Unijnym System Handlu Uprawnieniami do Emisji (EU ETS) i tym samym otrzymała przydziały bezpłatnych uprawnień do emisji dwutlenku węgla w okresie rozliczeniowym 2013-2020. SEJ przyznano łącznie 1 796 665 uprawnień do emisji o wartości rynkowej wyliczonej przez Komisję Europejską na 32 889 864 euro.
Warunkiem otrzymania bezpłatnych uprawnień do emisji jest wykonanie zadań inwestycyjnych, ujętych w Krajowym Planie Inwestycyjnym oraz wykorzystanie nakładów na ich realizację do rozliczenia przyznanych uprawnień.
W Krajowym Planie Inwestycji znajduje się 10 zadań inwestycyjnych, które zgłosiła SEJ, wśród nich są: budowa bloku fluidalnego oraz modernizacja kotłów i współspalania biomasy w Elektrociepłowni Zofiówka. Budowa nowych silnikowych agregatów prądotwórczych na metan w Elektrociepłowni Moszczenica, a także wymiany istniejących agregatów oraz budowa nowego agregatu gazowego w Zespole Elektrociepłowni Kogeneracyjnych.